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@yexiaoqi 2022-05-20T08:38:45.000000Z 字数 1205 阅读 330

HJ63. DNA序列

刷题


题目:一个 DNA 序列由 A/C/G/T 四个字母的排列组合组成。 G 和 C 的比例(定义为 GC-Ratio )是序列中 G 和 C 两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的 GC-Ratio 可能是基因的起始点。
给定一个很长的 DNA 序列,以及限定的子串长度 N ,请帮助研究人员在给出的 DNA 序列中从左往右找出 GC-Ratio 最高且长度为 N 的第一个子串。
DNA序列为 ACGT 的子串有: ACG , CG , CGT 等等,但是没有 AGT , CT 等等
数据范围:字符串长度满足 1≤n≤1000 ,输入的字符串只包含 A/C/G/T 字母

输入描述:输入一个string型基因序列,和int型子串的长度
输出描述:找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串
示例1

输入:ACGT
     2
输出:CG
说明:ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个,其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5,CG为1,故输出CG

示例2

输入:AACTGTGCACGACCTGA
     5
输出:GCACG
说明:虽然CGACC的GC-Ratio也是最高,但它是从左往右找到的GC-Ratio最高的第2个子串,所以只能输出GCACG。

链接https://www.nowcoder.com/practice/e8480ed7501640709354db1cc4ffd42a


  1. public class Main {
  2. public static void main(String[] args){
  3. Scanner sc = new Scanner(System.in);
  4. while(sc.hasNext()){
  5. String s = sc.next();
  6. int n = sc.nextInt();
  7. String[] subStr = new String[]{"ACG", "CG", "CGT"};
  8. int count = 0;
  9. String maxSubstring = null;
  10. //滑动窗口,窗口大小n
  11. for (int i=0; i<s.length()-n+1; i++) {
  12. String sub = s.substring(i, i+n);
  13. for (String s1 : subStr) {
  14. if(!sub.contains(s1)) continue;
  15. int ratio = countGcRatio(sub);
  16. if (ratio > count) {
  17. count = ratio;
  18. maxSubstring = sub;
  19. break;
  20. }
  21. }
  22. }
  23. System.out.println(maxSubstring);
  24. }
  25. }
  26. //字符串大小固定,只统计'C'、'G'的数量
  27. private static int countGcRatio(String s) {
  28. int ratio = 0;
  29. for (int i = 0; i < s.length(); i++) {
  30. char c = s.charAt(i);
  31. if (c=='C' || c=='G') ratio++;
  32. }
  33. return ratio;
  34. }
  35. }
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