安装fpocket2-王胖的生信笔记第37期

前两天实验室内师兄让我看下能不能安装fpocke2，反正就是一个软件做蛋白质预测之类的。我的工作和这方面没有任何关系，不过安装软件这一出，我估计之前没用过linux系统或者没使用过这类软件的会有一点小问题。

最简单的方法

所谓磨刀不误砍柴工，最简单的是使用conda安装。但是conda的安装和设置需要一定的学习，这个可以看站内生信卖萌哥的视频和相关推文（直接某度搜索conda，第一条应该就是）。

这个写的没问题，花一到两晚好好摸清conda 的用法（当然之前可能还需要花一到两晚摸清linux系统的一些基本操作），这对之你在linux系统下（或windows系统的cmd，Mac的terminal下）正常运用是及其有利的。

开始在conda环境下安装。

然后到了这一步选择Y（注意是按y然后回车）

然后就是耐心等待了

然后就装好了：

当然找个示范数据跑一下也没问题（具体怎么用我完全不了解哈，这个别问我）：

我就不用conda

当然我就不想用conda可以嘛？当然可以，你用筷子吃牛排，用刀叉吃红烧肉也没人管。

那怎办呢？

也有办法。最实惠的，就是按照github上fpocket团队的方法，用docker拉（pull）一个镜像，然后慢慢搞。但是这个就不说了，那个比较复杂，我也讲不好。

按照fpocket官网上的手册，也可以这么着：

这样写就行。当然现在官网下载的，tgz文件不是这个名，就按对应的改一下就行。但是改完会发觉make这一步要出错。

那怎么整？【以下解决方案仅针对fpocket2.tar.gz这个安装包】

点开bin，把名字里面所有尾缀带2的删除【是重命名，不是删除文件啊】，具体来说，就是fpocket2就改成fpocket、dpocket2改成dpocket、mdpocket2改成mdpocket、tpocket2改成tpocket。然后就运行后面的sudo make install，【注意要输入密码，这时候你可能看不见屏幕上有字符，但是没事，这就是这样的】。

如果你想一步到位，可以这样

curl -LO -k https://netcologne.dl.sourceforge.net/project/fpocket/fpocket2.tar.gz && \
    tar -xvzf fpocket2.tar.gz && rm fpocket2.tar.gz && cd fpocket2 && \
    sed -i 's/\$(LFLAGS) \$\^ -o \$@/\$\^ -o \$@ \$(LFLAGS)/g' makefile && make && \
    mv bin/fpocket bin/fpocket2 && mv bin/dpocket bin/dpocket2 && mv bin/mdpocket bin/mdpocket2 && mv bin/tpocket bin/tpocket2

&& 这个是分割命令， \ 这个是换行。

不知大家学会了吗？